More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2842 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  53.96 
 
 		 950 aa  954    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  54.54 
 
 		 925 aa  952    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 936 aa  1915    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 		 1820 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 		 1384 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 1305 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 801 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.29 
 
 		 887 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 1550 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1692 aa  424  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1069 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 1369 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1118 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  44.79 
 
 		 1346 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 		 1313 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.51 
 
 		 1397 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1202 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 946 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 977 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 929 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 921 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  42.91 
 
 		 1407 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  41.78 
 
 		 1135 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1398 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 		 758 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 830 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1240 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 816 aa  389  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.81 
 
 		 1499 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 957 aa  386  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.48 
 
 		 1442 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 1040 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.55 
 
 		 2213 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 705 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 682 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.38 
 
 		 1014 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1124 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 		 1001 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.8 
 
 		 1363 aa  373  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.85 
 
 		 1177 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 916 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1767 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 991 aa  366  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1326 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1767 aa  366  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1768 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  39.71 
 
 		 847 aa  365  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  40.5 
 
 		 1763 aa  363  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 1130 aa  360  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1765 aa  360  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1767 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1771 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 835 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1166 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1784 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1792 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1245 aa  353  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.21 
 
 		 1765 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1878 aa  352  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1782 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 993 aa  349  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 876 aa  349  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1033 aa  349  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.34 
 
 		 1331 aa  349  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1309 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1255 aa  347  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  33.98 
 
 		 750 aa  347  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 1574 aa  347  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1340 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1480 aa  346  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  36.76 
 
 		 765 aa  346  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1786 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1090 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1284 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 1548 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 833 aa  344  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1622 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 985 aa  343  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 770 aa  343  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.58 
 
 		 1468 aa  343  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.58 
 
 		 852 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1128 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.22 
 
 		 1109 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1267 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  39.3 
 
 		 1179 aa  336  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 1433 aa  336  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1611 aa  334  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.96 
 
 		 923 aa  334  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  34.15 
 
 		 861 aa  333  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1193 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1238 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  34.97 
 
 		 1030 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1238 aa  330  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1240 aa  330  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1238 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  39.46 
 
 		 977 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1238 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>