115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2733 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  100 
 
 
373 aa  765    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  35.2 
 
 
353 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.24 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  33.96 
 
 
350 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.96 
 
 
350 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.89 
 
 
364 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.42 
 
 
350 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.27 
 
 
352 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.15 
 
 
360 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.31 
 
 
357 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  37.17 
 
 
350 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  35.29 
 
 
349 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  35.01 
 
 
353 aa  199  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.15 
 
 
355 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.84 
 
 
361 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.14 
 
 
378 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  34.14 
 
 
378 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.31 
 
 
357 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.8 
 
 
366 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  33.88 
 
 
369 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  34.37 
 
 
306 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.37 
 
 
306 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  33.16 
 
 
373 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.04 
 
 
350 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.84 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.91 
 
 
354 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.45 
 
 
350 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.81 
 
 
350 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.37 
 
 
350 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.03 
 
 
355 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  40.14 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.49 
 
 
350 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  27.71 
 
 
359 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  27.69 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  34.31 
 
 
350 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  27.67 
 
 
350 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.67 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.08 
 
 
349 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  29.08 
 
 
349 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  28.4 
 
 
351 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29 
 
 
352 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  29.5 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  29 
 
 
344 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.46 
 
 
347 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.94 
 
 
377 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  26.02 
 
 
362 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.46 
 
 
368 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.57 
 
 
363 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  29.06 
 
 
413 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  30.15 
 
 
364 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  29.66 
 
 
363 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  27.47 
 
 
382 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  28.61 
 
 
378 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.75 
 
 
349 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.84 
 
 
373 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  22.1 
 
 
365 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.36 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  28.48 
 
 
396 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.81 
 
 
404 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  24.69 
 
 
656 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.94 
 
 
368 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  25.82 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  28.57 
 
 
404 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  24.2 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  27.86 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.07 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.27 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  27.74 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  27.92 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  24.08 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  23 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.69 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.77 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.07 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  29.34 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.88 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  30.86 
 
 
409 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  24.62 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0769  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.54 
 
 
323 aa  53.1  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1645  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.74 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0863125  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.07 
 
 
313 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0777  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.93 
 
 
323 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0068  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.45 
 
 
329 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1784  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.34 
 
 
326 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0323  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.15 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.51 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.13 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.86 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00208212  normal  0.0221839 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0133  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.72 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00186907  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1146  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.89 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319053  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0821  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.38 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0516766  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  21.92 
 
 
545 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.27 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2490  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.05 
 
 
329 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2739  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  19.57 
 
 
326 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2221  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.97 
 
 
424 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.00000055918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1407  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.9 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.766879  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0982  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.51 
 
 
313 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000366102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.51 
 
 
313 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0148108  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2519  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.01 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>