More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2693 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
873 aa  1782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  53 
 
 
714 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.85 
 
 
759 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.74 
 
 
1122 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.77 
 
 
935 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.35 
 
 
1344 aa  542  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.22 
 
 
838 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.89 
 
 
630 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.22 
 
 
703 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.17 
 
 
1418 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.4 
 
 
1021 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 
634 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.98 
 
 
576 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50.1 
 
 
1081 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.7 
 
 
1432 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.21 
 
 
1070 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.01 
 
 
1070 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.06 
 
 
654 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
682 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
1428 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
1222 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
647 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.84 
 
 
989 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
760 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0945  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
926 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
712 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
822 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
859 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
853 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
642 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1260 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
622 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
1260 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.38 
 
 
866 aa  282  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
645 aa  279  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1113 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
711 aa  277  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
857 aa  276  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1108 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  37.97 
 
 
945 aa  275  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
557 aa  274  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
983 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
677 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
673 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
945 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.14 
 
 
892 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
857 aa  269  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
912 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1322 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  34.03 
 
 
844 aa  268  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
882 aa  268  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
880 aa  268  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1279 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
796 aa  267  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  35.75 
 
 
872 aa  266  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
897 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
962 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
796 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
668 aa  266  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
819 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
776 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
713 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
991 aa  265  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  37.47 
 
 
527 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
872 aa  262  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
874 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
867 aa  262  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
849 aa  261  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
810 aa  260  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
867 aa  260  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
853 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
845 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
758 aa  258  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
853 aa  258  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
888 aa  257  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
673 aa  257  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
650 aa  257  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
770 aa  257  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
769 aa  257  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
661 aa  257  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
845 aa  257  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
850 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  33.05 
 
 
749 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
981 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.3 
 
 
916 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  34.87 
 
 
845 aa  255  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1176 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
736 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
743 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
657 aa  252  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
522 aa  253  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
840 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
793 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
639 aa  251  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
664 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
642 aa  251  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
817 aa  251  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>