150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2653 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
448 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  36.92 
 
 
500 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 
500 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 
471 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 
457 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  32.56 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
458 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  32.58 
 
 
455 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 
458 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  33.73 
 
 
458 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  33.98 
 
 
458 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 
500 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
483 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 
487 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  26.32 
 
 
501 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
500 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.03 
 
 
501 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 
484 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 
492 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
493 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
501 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 
493 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
507 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  24.23 
 
 
493 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 
510 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  26.13 
 
 
504 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.73 
 
 
510 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
504 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  28.32 
 
 
504 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  26.03 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.37 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
514 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
471 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.58 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  22.94 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1190  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.36 
 
 
508 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.31 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.31 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.18 
 
 
499 aa  69.7  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  20.71 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
493 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.56 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  22.25 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
480 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  19.57 
 
 
487 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  18.77 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
507 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  22.69 
 
 
492 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  20.6 
 
 
488 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 
479 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.36 
 
 
503 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  21.16 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.36 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.36 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.36 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  21.16 
 
 
492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.36 
 
 
510 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  21.16 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  21.16 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.05 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
494 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
508 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
508 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
469 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  21.16 
 
 
492 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
483 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  25.47 
 
 
506 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  21.16 
 
 
492 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>