More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2647 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  69.34 
 
 
212 aa  336  2e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  69.34 
 
 
212 aa  336  2e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  58.85 
 
 
214 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  53.14 
 
 
212 aa  254  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.40837e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  57.35 
 
 
215 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  57.62 
 
 
215 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.89 
 
 
212 aa  253  2e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  52.83 
 
 
212 aa  247  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  53.33 
 
 
213 aa  244  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
210 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
235 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.98 
 
 
213 aa  121  1e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
201 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
201 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
209 aa  109  2e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.99 
 
 
205 aa  109  2e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
214 aa  110  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
202 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
213 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.63 
 
 
196 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.41 
 
 
452 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
200 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
213 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31 
 
 
209 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.26 
 
 
222 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
240 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
208 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
209 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 
378 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
440 aa  94.7  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
223 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
223 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.99 
 
 
378 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.59 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
218 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
241 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.82 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.09 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.59 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
217 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
220 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.09 
 
 
203 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.35 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.6 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.35 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.35 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  26.11 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  34.57 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  34.57 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.6 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.6 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.85 
 
 
382 aa  88.2  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.63 
 
 
369 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.22 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.7528e-10  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
207 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  30.68 
 
 
194 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.52 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.44 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
210 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
253 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 
233 aa  85.1  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
449 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
201 aa  84.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.99 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.32678e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 
378 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.99 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.94009e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
211 aa  84.3  1e-15  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  8.5953e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
219 aa  84.7  1e-15  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.99 
 
 
203 aa  84.3  1e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.25652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 
210 aa  84.3  1e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.96 
 
 
442 aa  84.3  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>