More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2603 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  64.45 
 
 
465 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
469 aa  979    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  64.45 
 
 
465 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  65.8 
 
 
472 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  65.29 
 
 
465 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  62.72 
 
 
462 aa  611  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.56 
 
 
460 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  60.04 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.13 
 
 
457 aa  455  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  48.04 
 
 
460 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  48.03 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4161  coproporphyrinogen III oxidase  47.39 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0332782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
457 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  47.29 
 
 
465 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
457 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
457 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  47.71 
 
 
457 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 
485 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  47.93 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
457 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  46.84 
 
 
457 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  48.25 
 
 
457 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  48.25 
 
 
457 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  48.25 
 
 
457 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  47.53 
 
 
468 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 
463 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4224  coproporphyrinogen III oxidase  47.16 
 
 
457 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.365232  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  47.12 
 
 
480 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.07 
 
 
471 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3964  coproporphyrinogen III oxidase  47.61 
 
 
457 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0669093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  45.82 
 
 
463 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  46.15 
 
 
463 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 
470 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  46.72 
 
 
457 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
463 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.68 
 
 
478 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
463 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  44.74 
 
 
463 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 
473 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  44.94 
 
 
510 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  46.28 
 
 
482 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.45 
 
 
471 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.95 
 
 
458 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  45.41 
 
 
465 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 
471 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  44.69 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  44.9 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  46.33 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  46.39 
 
 
455 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 
494 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  44.3 
 
 
469 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.22 
 
 
457 aa  412  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 
494 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 
458 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 
458 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  45.61 
 
 
461 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 
446 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  44.8 
 
 
461 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  45.93 
 
 
455 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  44.25 
 
 
464 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.37 
 
 
471 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  44.03 
 
 
464 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  45.02 
 
 
458 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 
446 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  44.9 
 
 
489 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.05 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  45.22 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  45.58 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  46.44 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  46.67 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  46.02 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
483 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
481 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
483 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  43.11 
 
 
481 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
446 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 
446 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 
446 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 
446 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
483 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>