More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2588 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1188 aa  2419    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.78 
 
 
1188 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.02 
 
 
1193 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.8 
 
 
1221 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1213 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.16 
 
 
1208 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 
1190 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.96 
 
 
1196 aa  532  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 
1247 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.14 
 
 
1474 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.1 
 
 
1209 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1411 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.9 
 
 
696 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.85 
 
 
1652 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 
1557 aa  365  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.59 
 
 
1831 aa  360  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.96 
 
 
1454 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.38 
 
 
1363 aa  358  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.06 
 
 
1523 aa  357  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.91 
 
 
1443 aa  357  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.74 
 
 
1364 aa  356  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  36.22 
 
 
947 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.3 
 
 
1163 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1236 aa  333  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.36 
 
 
1868 aa  317  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.66 
 
 
1686 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.67 
 
 
930 aa  291  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.3 
 
 
1217 aa  289  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 
1711 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.66 
 
 
919 aa  283  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.46 
 
 
1901 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.57 
 
 
1357 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  33.99 
 
 
1661 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 
1481 aa  277  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.6 
 
 
1510 aa  276  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 
1552 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.71 
 
 
1807 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.26 
 
 
1789 aa  274  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  28.38 
 
 
1229 aa  273  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.64 
 
 
1367 aa  272  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.7 
 
 
1760 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 
1553 aa  265  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.46 
 
 
1609 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 
1211 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.95 
 
 
1684 aa  252  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.11 
 
 
1599 aa  252  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.37 
 
 
1161 aa  251  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.85 
 
 
1161 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.85 
 
 
1416 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.62 
 
 
1242 aa  247  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.99 
 
 
1262 aa  246  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.06 
 
 
1714 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.67 
 
 
1598 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.64 
 
 
1164 aa  234  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 
1878 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 
1344 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.84 
 
 
1547 aa  232  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 
1766 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.45 
 
 
677 aa  231  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 
1656 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.43 
 
 
924 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.98 
 
 
1484 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.21 
 
 
1583 aa  227  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27 
 
 
1626 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.24 
 
 
740 aa  226  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.16 
 
 
1214 aa  225  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.69 
 
 
1304 aa  222  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.94 
 
 
1240 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.9 
 
 
1617 aa  220  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  23.96 
 
 
1280 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.55 
 
 
1607 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.7 
 
 
1330 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.87 
 
 
1177 aa  218  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.2 
 
 
1823 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  31.69 
 
 
344 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.92 
 
 
1041 aa  215  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  34.95 
 
 
316 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.01 
 
 
1004 aa  215  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.7 
 
 
1348 aa  215  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  39.15 
 
 
742 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.6 
 
 
1176 aa  214  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.9 
 
 
728 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.48 
 
 
676 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.3 
 
 
1039 aa  214  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 
344 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 
1858 aa  212  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.96 
 
 
1016 aa  212  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.78 
 
 
1016 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.14 
 
 
608 aa  211  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 
1373 aa  208  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  32.4 
 
 
316 aa  208  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.34 
 
 
1856 aa  207  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.93 
 
 
434 aa  206  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.74 
 
 
1623 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  33.56 
 
 
335 aa  206  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.6 
 
 
1334 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.12 
 
 
1267 aa  204  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 
1311 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.15 
 
 
630 aa  201  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.17 
 
 
596 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>