More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2524 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  50.15 
 
 
657 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  52.58 
 
 
665 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
656 aa  1353    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  51.15 
 
 
653 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  50.76 
 
 
656 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  50.75 
 
 
639 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  46.93 
 
 
634 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 
697 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  38.63 
 
 
697 aa  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.86 
 
 
743 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  37.12 
 
 
662 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  36.62 
 
 
787 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  34.66 
 
 
744 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.56 
 
 
1085 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  33.44 
 
 
671 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  32.52 
 
 
689 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 
725 aa  267  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  51.85 
 
 
619 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  31.92 
 
 
698 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
680 aa  258  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  37.38 
 
 
788 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 
749 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  37.98 
 
 
1193 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  31.37 
 
 
682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  42.43 
 
 
652 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  45.39 
 
 
450 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 
450 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  53.02 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  50.99 
 
 
444 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  43.63 
 
 
432 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  37.1 
 
 
687 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  35.18 
 
 
646 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  29.3 
 
 
622 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  42.97 
 
 
442 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.58 
 
 
434 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  42.21 
 
 
466 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  47.04 
 
 
725 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  47.16 
 
 
448 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.15 
 
 
441 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  41.31 
 
 
450 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  46.48 
 
 
445 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  43.7 
 
 
448 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  43.27 
 
 
459 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  41.08 
 
 
478 aa  184  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  31.84 
 
 
678 aa  183  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.63 
 
 
478 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0994  hypothetical protein  29.32 
 
 
354 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  52.42 
 
 
134 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.81 
 
 
569 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
577 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  34.4 
 
 
299 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.3 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.44 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  31.92 
 
 
580 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  30.92 
 
 
570 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.94 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30.92 
 
 
570 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.4 
 
 
578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.61 
 
 
305 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  38.51 
 
 
617 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  33.95 
 
 
387 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
228 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  41.38 
 
 
772 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  33.18 
 
 
822 aa  98.2  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.78 
 
 
723 aa  94  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  40.74 
 
 
789 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  36.61 
 
 
326 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  42.75 
 
 
795 aa  92.8  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  32.28 
 
 
766 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  42.55 
 
 
789 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  37.41 
 
 
686 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  32.43 
 
 
426 aa  91.3  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.19 
 
 
781 aa  90.9  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 
697 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.01 
 
 
405 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.01 
 
 
784 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30 
 
 
405 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.01 
 
 
781 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.01 
 
 
800 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  30.45 
 
 
436 aa  88.6  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35.16 
 
 
328 aa  89  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.28 
 
 
732 aa  88.6  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  38.06 
 
 
775 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  27.08 
 
 
421 aa  87.4  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  33.16 
 
 
443 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  33.51 
 
 
326 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.44 
 
 
801 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  28.91 
 
 
771 aa  87  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.13 
 
 
336 aa  86.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  27.73 
 
 
391 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.56 
 
 
428 aa  87  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.5 
 
 
425 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.03 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 
773 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  30.21 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
773 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  37.23 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.15 
 
 
718 aa  85.1  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  31.72 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>