More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2497 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  100 
 
 		 384 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  39.95 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  34.92 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  32.49 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  34.01 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  47.72 
 
 		 209 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  30.71 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  30.29 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  31.73 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  29.08 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  30.69 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  28.31 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  26.86 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.73 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.13 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  45.08 
 
 		 147 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  26.41 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.5 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  32.8 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24051  hypothetical protein  25.55 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  24.79 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  25.62 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  25.62 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  25.62 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28.42 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  26.06 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  23.4 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.45 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  29.65 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  25.06 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  23.48 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  29.57 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  24.29 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  27.64 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.49 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  29.19 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.34 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  23.81 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  23.23 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  23.56 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  27.42 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  23.05 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  28.57 
 
 		 216 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  21.95 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.7 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  28.9 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  27.39 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  20 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.59 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  26.5 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.12 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  29.12 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.86 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  20 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  20 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.63 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.86 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  20 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  23.51 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  20.57 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.26 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  19.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  20.36 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.55 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  27.27 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.62 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.46 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.25 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.25 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.21 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  19.86 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.01 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  30.34 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  23.55 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  27.42 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.36 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.36 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.36 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.23 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  22.03 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  21.68 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>