23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2416 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  94.25 
 
 		 400 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  50.88 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  39.47 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  38.96 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  37.33 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  45.9 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  36 
 
 		 178 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  46.03 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 819 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0214  Cation transport ATPase-like protein  32.53 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 743 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  31.11 
 
 		 737 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 		 805 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  36.84 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2990  hypothetical protein  30.77 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  30.93 
 
 		 716 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  27.12 
 
 		 210 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  31.18 
 
 		 766 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0757  hypothetical protein  25.26 
 
 		 154 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.479528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.31 
 
 		 770 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 		 723 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3555  hypothetical protein  40.26 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0363608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>