More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2267 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 265 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  48.45 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  50.35 
 
 		 403 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  52.71 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0463  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  54.33 
 
 		 403 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 		 387 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.18 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  46.67 
 
 		 352 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.47 
 
 		 365 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  47.24 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 		 589 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.41 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 1341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 904 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  32.32 
 
 		 1343 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  49.6 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.12 
 
 		 352 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  30.86 
 
 		 993 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.84 
 
 		 348 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.35 
 
 		 1370 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  27.91 
 
 		 961 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  31.15 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 204 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.46 
 
 		 1355 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  28.4 
 
 		 1324 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 1349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  29.13 
 
 		 1335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  28.79 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.84 
 
 		 1347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.69 
 
 		 1366 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  28.24 
 
 		 1313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  27.34 
 
 		 1374 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  46.72 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.13 
 
 		 1340 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  27.86 
 
 		 1400 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  26.64 
 
 		 1296 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  27.61 
 
 		 1278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  25.88 
 
 		 1373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  27.97 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.29 
 
 		 1396 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.67 
 
 		 1131 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  29.08 
 
 		 1388 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  27.89 
 
 		 1355 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 1201 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.07 
 
 		 1378 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  30.12 
 
 		 1374 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.1 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.76 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4604  two component transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  27.24 
 
 		 1378 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  27.38 
 
 		 1384 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 394 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  28.57 
 
 		 1347 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  35.26 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  28.36 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  29.13 
 
 		 1366 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 566 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  30.59 
 
 		 1414 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  24.43 
 
 		 1418 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  39.85 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.48 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1069  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1066  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>