236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2230 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  36.41 
 
 
320 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  46.48 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  39.49 
 
 
224 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  38.28 
 
 
716 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  41.26 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  39.09 
 
 
226 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.76 
 
 
717 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 
325 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.05 
 
 
236 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  39.05 
 
 
236 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  39.05 
 
 
236 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  39.05 
 
 
236 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  39.86 
 
 
250 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  39.05 
 
 
236 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  39.05 
 
 
236 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  35.8 
 
 
722 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  37.87 
 
 
236 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  40.15 
 
 
192 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  38.46 
 
 
236 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.78 
 
 
228 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  39.29 
 
 
738 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  37.13 
 
 
716 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  36.67 
 
 
222 aa  99  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  35.75 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.48 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  38.93 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.5 
 
 
713 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.09 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.53 
 
 
746 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  36.55 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  34.54 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.59 
 
 
722 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.59 
 
 
722 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  34.24 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  34.09 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.36 
 
 
623 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  38.41 
 
 
227 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  34.66 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  32.6 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  32.92 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  32.92 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  33.91 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.72 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 
264 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  36.77 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  32.45 
 
 
304 aa  85.1  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.92 
 
 
714 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 
717 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  32.43 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.69 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  33.33 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  27.96 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  30.27 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  33.83 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  32.26 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  32.18 
 
 
717 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  33.86 
 
 
714 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  33.75 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  29.23 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  35.16 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.12 
 
 
712 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.5 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.43 
 
 
713 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  30.54 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 
704 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  26.74 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.09 
 
 
705 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.57 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.25 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  29.63 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.4 
 
 
735 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  31.39 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  32.41 
 
 
720 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.82 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  28.43 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  27.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  33.85 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  25.33 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.86 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  29.93 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  33.08 
 
 
266 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  29.46 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.08 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.17 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  32 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  35.04 
 
 
714 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>