19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2185 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  100 
 
 
114 aa  227  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  70.59 
 
 
114 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  70.59 
 
 
114 aa  156  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  70.71 
 
 
121 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  35.71 
 
 
101 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  36.9 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  36.78 
 
 
142 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  35.29 
 
 
301 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  37.65 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.27 
 
 
307 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.61 
 
 
326 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.7 
 
 
328 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  32.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1328  hypothetical protein  34.04 
 
 
91 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.78 
 
 
306 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  33.65 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.38 
 
 
344 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>