51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2128 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  78.41 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  78.41 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  64.2 
 
 
95 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  61.73 
 
 
95 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  64.2 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  59.04 
 
 
88 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  56.25 
 
 
90 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  60 
 
 
101 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  56.25 
 
 
106 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  58.75 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  58.75 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  60 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  54.43 
 
 
108 aa  96.7  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  54.43 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  57.5 
 
 
99 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  56.96 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  52.38 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  53.75 
 
 
111 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  48.86 
 
 
107 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  47.73 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  48.1 
 
 
111 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  46.43 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  47.62 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  46.43 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  51.25 
 
 
126 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  46.07 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  46.43 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  51.32 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  51.32 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  45.83 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  50 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1394  NifZ  47.06 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  44.29 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  42.86 
 
 
321 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  40 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  40.28 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  40.54 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  39.19 
 
 
119 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  32 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  36.49 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  37.33 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  36.49 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  38.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  32.47 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  39.19 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  34.25 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1451  hypothetical protein  35.21 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  36 
 
 
81 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  32.43 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  32.43 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>