36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2113 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  100 
 
 
159 aa  329  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  66.04 
 
 
156 aa  227  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  66.04 
 
 
156 aa  226  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  56.41 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  57.86 
 
 
158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  56.6 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  56.6 
 
 
158 aa  193  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  51.08 
 
 
156 aa  157  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  44.03 
 
 
155 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  46.1 
 
 
152 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  44.03 
 
 
154 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  44.03 
 
 
154 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  42.58 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  43.45 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  43.45 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  41.33 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  47.52 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  42.55 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  42.57 
 
 
156 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  44.68 
 
 
157 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  42.34 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  38.71 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  41.13 
 
 
156 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  40.85 
 
 
149 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  40.27 
 
 
153 aa  120  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  39.24 
 
 
158 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  39.29 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  35.44 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  40.76 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  40.29 
 
 
160 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  38.13 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  38.13 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  37.42 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  36.62 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  35.06 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>