More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2059 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 145 aa  294  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  62.68 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  55.47 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  42.96 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  43.27 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  41.51 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  47.12 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  42.72 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  39.09 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  41.28 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 136 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  31.5 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  41.28 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  32.33 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.97 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  36.97 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.28 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  32.03 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  36.19 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>