61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2057 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  100 
 
 		 59 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  77.59 
 
 		 58 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  77.59 
 
 		 58 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  81.48 
 
 		 56 aa  97.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  78.18 
 
 		 56 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  76.36 
 
 		 56 aa  93.6  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  76.47 
 
 		 54 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.94 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  46.55 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  44.83 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  43.75 
 
 		 50 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  47.92 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  58.54 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  43.75 
 
 		 50 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  46.43 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  42.86 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  47.92 
 
 		 50 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  44.64 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  45.83 
 
 		 50 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  45.83 
 
 		 50 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  41.67 
 
 		 50 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  45.9 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  45.83 
 
 		 50 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  52.27 
 
 		 45 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  55.81 
 
 		 47 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  53.49 
 
 		 47 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  51.16 
 
 		 47 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  51.16 
 
 		 47 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  53.49 
 
 		 47 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  57.14 
 
 		 48 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  48.84 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  61.11 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  48.78 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  52.38 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  53.49 
 
 		 46 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  48.84 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  43.48 
 
 		 50 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  48.89 
 
 		 48 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  36.84 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  51.16 
 
 		 46 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  57.5 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  48.84 
 
 		 48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  48.84 
 
 		 48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  48.84 
 
 		 48 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  48.84 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  51.16 
 
 		 46 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  47.62 
 
 		 48 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  47.62 
 
 		 48 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  50 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45.28 
 
 		 55 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  48.78 
 
 		 48 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  51.16 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  37.74 
 
 		 59 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  37.5 
 
 		 72 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  42.55 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  55 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  55.56 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13681  high light inducible protein  54.55 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  34.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  48.78 
 
 		 79 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>