More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2012 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.06 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.06 
 
 		 226 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.67 
 
 		 183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.33 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.51 
 
 		 218 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.06 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  43.75 
 
 		 148 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 		 143 aa  84.7  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  29.84 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 136 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  26.23 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.61 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.73754  normal  0.0224033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.61 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.61 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.73 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.61 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.61 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  26.27 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.61 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11800  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.75 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30.83 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  26.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  26.32 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  27.27 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.46 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  30.83 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  29.23 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.97 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  24.17 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  24.59 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  28.66 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  28.66 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.3 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  25.83 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  31.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  29.6 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  26.23 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  30.43 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  24.6 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.61 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.35 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.69 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  33.33 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  27.87 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  30.3 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.65 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.83 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  24.22 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.77 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  25.42 
 
 		 128 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>