More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2005 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
512 aa  1053    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  53.36 
 
 
1694 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  47.9 
 
 
1276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  48.21 
 
 
1007 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.75 
 
 
707 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 
602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  50 
 
 
344 aa  200  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  43.5 
 
 
573 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 
4489 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  44.4 
 
 
543 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.82 
 
 
397 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
1192 aa  192  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  44.35 
 
 
523 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.91 
 
 
784 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 
927 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  41.06 
 
 
1276 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  42.02 
 
 
3035 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 
3560 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 
1094 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.59 
 
 
582 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
711 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.61 
 
 
730 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  38 
 
 
623 aa  176  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.46 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 
542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  28.54 
 
 
706 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  37.92 
 
 
314 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  46.84 
 
 
681 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 
878 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  28.13 
 
 
706 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  34.04 
 
 
564 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 
4079 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  40.6 
 
 
559 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 
362 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.98 
 
 
810 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 
833 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 
617 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  28.88 
 
 
508 aa  156  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
1827 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
750 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
352 aa  153  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.74 
 
 
1138 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  41.58 
 
 
560 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  38.5 
 
 
452 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  43.56 
 
 
743 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0174  GUN4-like  38.06 
 
 
552 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
465 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  25.97 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.39 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  35.42 
 
 
745 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.03 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.46 
 
 
836 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
685 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  32.94 
 
 
334 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
955 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
391 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.85 
 
 
292 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  36.5 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 
716 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  40.85 
 
 
865 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.3 
 
 
576 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
1979 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  36.63 
 
 
764 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
761 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
909 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  40.66 
 
 
725 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 
589 aa  137  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 
637 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
740 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  43.71 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.78 
 
 
784 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
1049 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
699 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
3301 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  35.68 
 
 
622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.12 
 
 
296 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2617  GUN4-like  35.96 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000986346  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 
409 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.83 
 
 
620 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 
1022 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
804 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
620 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 
818 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
244 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.48 
 
 
750 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
329 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
3145 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
1737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.93 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
648 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
591 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>