More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1998 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  62.53 
 
 
786 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
817 aa  1534    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.71 
 
 
1197 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  54.55 
 
 
2251 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  52.27 
 
 
8682 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  52.27 
 
 
2542 aa  79.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  54.55 
 
 
5218 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  52.27 
 
 
9030 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  51.14 
 
 
4678 aa  77.8  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.98 
 
 
3427 aa  77.8  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.14 
 
 
5962 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  52.94 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
2704 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
686 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.27 
 
 
5839 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  34.15 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  37.68 
 
 
759 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  57.5 
 
 
3314 aa  71.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  36.9 
 
 
856 aa  71.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  50 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.86 
 
 
6753 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  56.52 
 
 
4106 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 
2097 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
2105 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  46.08 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.93 
 
 
1795 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.13 
 
 
1166 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  45.19 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.41 
 
 
1145 aa  68.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42 
 
 
4687 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  59.02 
 
 
7149 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.57 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  46.59 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  57.97 
 
 
1883 aa  67.8  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  42.86 
 
 
7284 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  38.52 
 
 
517 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.94 
 
 
874 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.09 
 
 
1403 aa  66.6  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 
385 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  59.02 
 
 
4798 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.65 
 
 
1164 aa  66.6  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  50 
 
 
889 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.36 
 
 
556 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  41.82 
 
 
621 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.7 
 
 
2678 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.46 
 
 
202 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.46 
 
 
202 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  47.62 
 
 
1346 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  45.3 
 
 
2743 aa  65.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  53.16 
 
 
260 aa  65.1  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  49.37 
 
 
1499 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  42.2 
 
 
313 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  43.68 
 
 
4854 aa  65.1  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
932 aa  65.1  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  50.77 
 
 
717 aa  65.1  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  49.37 
 
 
2689 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.69 
 
 
946 aa  64.3  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  51.39 
 
 
1055 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  48.19 
 
 
1534 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 
4220 aa  63.9  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 
2336 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 
503 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  50.65 
 
 
1424 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  48.05 
 
 
2667 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  47.92 
 
 
1202 aa  64.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  49.38 
 
 
2452 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 
424 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  41.38 
 
 
1121 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.7 
 
 
593 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.17 
 
 
1895 aa  63.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  44.55 
 
 
561 aa  63.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 
243 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  49.38 
 
 
1168 aa  63.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  51.9 
 
 
421 aa  63.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  46.25 
 
 
3598 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  43 
 
 
313 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  49.37 
 
 
3608 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  41.38 
 
 
1111 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06181  hypothetical protein  37.39 
 
 
277 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0381499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  44.96 
 
 
2160 aa  62.4  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  50 
 
 
1019 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.67 
 
 
6662 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.67 
 
 
6779 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  38.79 
 
 
917 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  45.33 
 
 
4848 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.67 
 
 
6683 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  41.59 
 
 
329 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  43.4 
 
 
2042 aa  62.4  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.62 
 
 
1839 aa  62.4  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  45.36 
 
 
5442 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  41.59 
 
 
329 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  41.05 
 
 
768 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.67 
 
 
2239 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
491 aa  61.6  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
375 aa  62  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 
1532 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  47.62 
 
 
998 aa  61.6  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.93 
 
 
1279 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  52.38 
 
 
2192 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>