More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1989 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
354 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  60.91 
 
 
356 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  60.91 
 
 
356 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.59 
 
 
327 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  56.21 
 
 
326 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.02 
 
 
349 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  55.77 
 
 
325 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  44.3 
 
 
344 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.48 
 
 
324 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.51 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  31.58 
 
 
327 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  31.01 
 
 
322 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.23 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.07 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  28.44 
 
 
325 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  30.36 
 
 
371 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  29.57 
 
 
367 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  25 
 
 
342 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  25.74 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.21 
 
 
368 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  27.5 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  28.13 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  27.49 
 
 
264 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  27.88 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  25.33 
 
 
283 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.78 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  27.05 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  28.92 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  24.43 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  27.03 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.14 
 
 
366 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.45 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.99 
 
 
347 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.3 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.69 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.93 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  25.94 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  29.51 
 
 
386 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  28.03 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.8 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  26.76 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.23 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.29 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  23.62 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.08 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  26.04 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.08 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.38 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  27.67 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  26.3 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  26.49 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.74 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.7 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.69 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3548  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.14 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.033061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.15 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.2 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.01 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.93 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.46 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  25.97 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  26.5 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
817 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.85 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.93 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.85 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.39 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  27.27 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.55 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
843 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  24.6 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  23.78 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
815 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  27.82 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.12 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  25.87 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  24.42 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.93 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.23 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  27.97 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.63 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18191  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.81 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.38 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  25.35 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.58 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  24.16 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.36 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  23.72 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  24.92 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.23 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.24 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.32 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  25.3 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.78 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.92 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.88 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>