More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1983 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 
423 aa  860    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  74.11 
 
 
423 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  74.11 
 
 
423 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.54 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.29 
 
 
425 aa  558  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1471  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.19 
 
 
423 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.61 
 
 
433 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.35 
 
 
433 aa  462  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.84 
 
 
425 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.82 
 
 
422 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.79 
 
 
425 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.29 
 
 
423 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
428 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
428 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.05 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.59 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.71 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.05 
 
 
422 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 
427 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.31 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
427 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.12 
 
 
427 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.84 
 
 
430 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2076  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.05 
 
 
438 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.552059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
430 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.88 
 
 
430 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
426 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 
419 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
428 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
429 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 
419 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.92 
 
 
433 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.59 
 
 
422 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  48.48 
 
 
429 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.24 
 
 
429 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
422 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.36 
 
 
429 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 
429 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
425 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
436 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.64 
 
 
421 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
425 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
428 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
429 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
429 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
429 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 
429 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
429 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  48.48 
 
 
429 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
428 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
456 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
591 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 
430 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 
428 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.94 
 
 
427 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.83 
 
 
429 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
428 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.84 
 
 
428 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
425 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.06 
 
 
422 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
426 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
429 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
429 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 
422 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 
426 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.89 
 
 
430 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 
429 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
432 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 
422 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 
437 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.07 
 
 
425 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.87 
 
 
424 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.24 
 
 
424 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.65 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
425 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 
429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 
429 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
428 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.95 
 
 
431 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 
427 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
426 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 
425 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.01 
 
 
429 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.58 
 
 
419 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
423 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.78 
 
 
429 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 
423 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.54 
 
 
430 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.69 
 
 
419 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.6 
 
 
428 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.01 
 
 
431 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.18 
 
 
424 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>