41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1945 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.64 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  28.64 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.88 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.88 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  22.74 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  24.42 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  24.88 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  26.03 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.45 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.69 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  25.45 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  25.69 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.8 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  23.61 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  26.74 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  26.74 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.69 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  23.66 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  22.56 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.15 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  22.03 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  23 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  23.04 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  23.04 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.34 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.17 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.41 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  29.36 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.09 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.08 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.9 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.23 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  30.11 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.47 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.85 
 
 		 260 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>