97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1894 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  79.48 
 
 		 270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  79.48 
 
 		 270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  72.76 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  72.08 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  31.42 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  28.27 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  28.47 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  29.17 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.82 
 
 		 448 aa  72.4  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  30.43 
 
 		 366 aa  72  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  26.54 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  27.39 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  27.39 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  28.23 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  29.49 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  29.49 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  29.49 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 349 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  27.62 
 
 		 402 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  27.43 
 
 		 513 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  27.7 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.77 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  28.06 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  28.99 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  28.22 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  31.44 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  24.66 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  25.97 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.83 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  28.67 
 
 		 542 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  25.41 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.21 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  27.54 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  26.55 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  26.91 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  26.39 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  26.09 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.43 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  25.24 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  29.38 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  29.19 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 388 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.94 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  25.45 
 
 		 351 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  36.36 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  28.23 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  27.36 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  24.08 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  26.7 
 
 		 348 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.37 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  28.21 
 
 		 337 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  25.37 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  25.73 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  25.74 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  23.62 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  21.94 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  33.33 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  33.75 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  26.42 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  41.18 
 
 		 337 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  27.14 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  34.78 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.06 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26.88 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.78 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  25.12 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  27.23 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  25.12 
 
 		 310 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  42.62 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  23.92 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  30.63 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  28.02 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  37.7 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  28.06 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  26.44 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  26.53 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3201  Squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 357 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  30.85 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  34.85 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  37.5 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02163  phytoene synthase  34.29 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  28.8 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  26.7 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  32.93 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.76 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.24 
 
 		 313 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  36.59 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  25.65 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>