68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1890 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1890  protein of unknown function DUF552  100 
 
 
124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000364374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0253  protein of unknown function DUF552  41.67 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1714  protein of unknown function DUF552  44.05 
 
 
190 aa  83.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00287605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1695  protein of unknown function DUF552  44.05 
 
 
190 aa  83.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0549  protein of unknown function DUF552  42.86 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1730  hypothetical protein  43.37 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04471  hypothetical protein  43.37 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.811311  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2059  hypothetical protein  43.53 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976966  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04571  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2922  protein of unknown function DUF552  42.53 
 
 
107 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04151  hypothetical protein  40.96 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0391  hypothetical protein  40.96 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.151503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04461  hypothetical protein  40.96 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0691442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2024  hypothetical protein  34.26 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166297  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03921  hypothetical protein  39.76 
 
 
192 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21471  hypothetical protein  32.67 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4422  hypothetical protein  36.96 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000112454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4907  hypothetical protein  41.56 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0835083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1471  protein of unknown function DUF552  40.26 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000569683  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0648  hypothetical protein  39.76 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.802992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2900  hypothetical protein  40.26 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000121592  unclonable  0.000000137854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0713  hypothetical protein  39.73 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1083  protein of unknown function DUF552  37.04 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364899  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1320  hypothetical protein  32.29 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197076  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1413  hypothetical protein  34.57 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000663721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4046  protein of unknown function DUF552  33.33 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00125634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1035  protein of unknown function DUF552  36.14 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000196256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09230  hypothetical protein  30.14 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00237641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1241  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000979962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3913  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000167056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4000  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000660664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3951  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1016  protein of unknown function DUF552  32.14 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3944  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3750  ylmF protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0779289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3641  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000538076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3658  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4038  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00196777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3726  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0030403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0954  hypothetical protein  31.76 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000107088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2548  hypothetical protein  29.49 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.232838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1248  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0754  ylmF protein  32.05 
 
 
197 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1905  protein of unknown function DUF552  30.95 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2107  hypothetical protein  32.1 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000203247  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1821  hypothetical protein  32.1 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000225081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0597  protein of unknown function DUF552  30.77 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000329372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1891  hypothetical protein  22.78 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1486  hypothetical protein  27.71 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0859  hypothetical protein  28.75 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00767621  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0791  hypothetical protein  30.56 
 
 
155 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000158069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1345  protein of unknown function DUF552  29.73 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000191769  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0311  hypothetical protein  28 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13351  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.703237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1200  cell division protein  25.71 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5757  protein of unknown function DUF552  25.32 
 
 
215 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1412  hypothetical protein  24.69 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1316  protein of unknown function DUF552  31.34 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000581957  normal  0.957732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1421  hypothetical protein  24.69 
 
 
187 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00683826  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3522  protein of unknown function DUF552  26.83 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2640  protein of unknown function DUF552  25 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.340811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5091  hypothetical protein  24.69 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153174  hitchhiker  0.00267894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1491  cell division protein  21.05 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1142  cell division protein  23.68 
 
 
180 aa  43.5  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0594  hypothetical protein  22.67 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195332  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0391  hypothetical protein  25.71 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2060  cell division protein  21.28 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>