More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1804 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1186 aa  2403    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 1215 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  41.92 
 
 		 1507 aa  664    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  39.22 
 
 		 1328 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.36 
 
 		 767 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  50.33 
 
 		 725 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  49.89 
 
 		 1044 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.57 
 
 		 919 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 		 1105 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  37.94 
 
 		 2145 aa  389  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  46.12 
 
 		 1039 aa  389  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  48.51 
 
 		 924 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  48.47 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.8 
 
 		 771 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.12 
 
 		 1424 aa  363  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  40.45 
 
 		 1550 aa  363  2e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.7 
 
 		 787 aa  361  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 		 968 aa  360  9e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  54.44 
 
 		 843 aa  360  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  54.79 
 
 		 825 aa  354  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.53 
 
 		 885 aa  351  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  44.08 
 
 		 454 aa  346  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  58.69 
 
 		 568 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.69 
 
 		 568 aa  337  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  38.38 
 
 		 1262 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 		 1050 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  40.14 
 
 		 1185 aa  303  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.35 
 
 		 1475 aa  298  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  45.88 
 
 		 911 aa  297  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  38.61 
 
 		 1488 aa  292  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1404 aa  292  3e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 1128 aa  283  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  41.34 
 
 		 493 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 		 1288 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  53.08 
 
 		 672 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 937 aa  267  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  44.87 
 
 		 444 aa  266  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1054 aa  263  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  39.58 
 
 		 822 aa  262  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  49.31 
 
 		 751 aa  260  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  50.17 
 
 		 977 aa  258  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  36.2 
 
 		 732 aa  251  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  52.05 
 
 		 680 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  58.53 
 
 		 481 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 		 953 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  51.22 
 
 		 284 aa  243  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.44 
 
 		 991 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  31.61 
 
 		 694 aa  236  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 		 837 aa  234  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.32 
 
 		 1040 aa  233  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1060 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  33.49 
 
 		 919 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1365 aa  228  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  37.37 
 
 		 1106 aa  226  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 649 aa  224  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 1290 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  41.14 
 
 		 362 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 782 aa  223  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  41.14 
 
 		 814 aa  221  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  36.89 
 
 		 1125 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.94 
 
 		 1056 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  43.24 
 
 		 1228 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 949 aa  210  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.76 
 
 		 1131 aa  207  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 		 1028 aa  207  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 443 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1409 aa  204  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1068 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 1119 aa  201  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 		 828 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  37.57 
 
 		 963 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1212 aa  199  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  44.4 
 
 		 311 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.75 
 
 		 740 aa  196  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.52 
 
 		 991 aa  196  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 		 857 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 966 aa  193  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.52 
 
 		 1009 aa  191  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.11 
 
 		 708 aa  189  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 		 785 aa  183  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.97 
 
 		 2327 aa  182  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1088 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  31.11 
 
 		 1266 aa  181  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1313 aa  181  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 1283 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  28.6 
 
 		 985 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  45.41 
 
 		 212 aa  171  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  28.64 
 
 		 686 aa  168  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.03 
 
 		 851 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.13 
 
 		 1324 aa  165  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.7 
 
 		 1694 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  48.31 
 
 		 190 aa  163  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 669 aa  163  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 667 aa  163  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 878 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  44.86 
 
 		 304 aa  161  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 		 1136 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1238 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 543 aa  151  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 776 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>