More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1734 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 697 aa  1431    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  40.06 
 
 		 657 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 		 639 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  41.61 
 
 		 653 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 		 656 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 665 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 		 656 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  39.9 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  38.56 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.52 
 
 		 743 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  35.02 
 
 		 744 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  35.52 
 
 		 787 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 		 662 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  30.9 
 
 		 680 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  52.42 
 
 		 698 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  43.81 
 
 		 652 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  53.08 
 
 		 671 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  46.95 
 
 		 682 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  44.79 
 
 		 725 aa  244  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.72 
 
 		 1085 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 		 788 aa  240  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  49.18 
 
 		 619 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  47.31 
 
 		 689 aa  230  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  47.6 
 
 		 749 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  45.96 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  45.96 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  47.88 
 
 		 687 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  45.1 
 
 		 432 aa  218  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 		 442 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  46.99 
 
 		 450 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  44.49 
 
 		 1193 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  39.93 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  45.74 
 
 		 444 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  42.02 
 
 		 448 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  43.9 
 
 		 622 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.98 
 
 		 441 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  41.09 
 
 		 434 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  45.42 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  42.47 
 
 		 478 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  40.54 
 
 		 448 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  43.89 
 
 		 725 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  43.78 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  41.7 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  36.14 
 
 		 678 aa  173  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.07 
 
 		 570 aa  145  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  52.42 
 
 		 134 aa  141  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  35.45 
 
 		 299 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.75 
 
 		 305 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  32.55 
 
 		 570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  32.55 
 
 		 570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.58 
 
 		 569 aa  132  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  32.16 
 
 		 570 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.36 
 
 		 352 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.18 
 
 		 578 aa  130  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  31.7 
 
 		 580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.74 
 
 		 577 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  34.95 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 		 228 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.81 
 
 		 387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0994  hypothetical protein  25.93 
 
 		 354 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 		 328 aa  97.8  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 		 697 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  33.68 
 
 		 328 aa  97.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.16 
 
 		 781 aa  96.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.65 
 
 		 723 aa  95.5  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.71 
 
 		 784 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.71 
 
 		 781 aa  94.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.59 
 
 		 336 aa  92.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  39.57 
 
 		 772 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  31.87 
 
 		 328 aa  91.3  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  29.46 
 
 		 335 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.94 
 
 		 800 aa  90.5  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.83 
 
 		 332 aa  89  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  34.67 
 
 		 686 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  35.03 
 
 		 771 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  28.69 
 
 		 393 aa  88.2  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  29.62 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  28.36 
 
 		 335 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  33.92 
 
 		 464 aa  87.4  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  32.44 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  28.12 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 		 795 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  29.64 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  28.9 
 
 		 335 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.27 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  29.74 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  33.71 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  26.25 
 
 		 691 aa  85.9  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.57 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  37.5 
 
 		 789 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.79 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  39.13 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  30.32 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.7 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  35.76 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.96 
 
 		 327 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  32.76 
 
 		 731 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>