More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1705 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  62.01 
 
 
177 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  41.56 
 
 
175 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  44.38 
 
 
178 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  43.48 
 
 
174 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 
174 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  43.48 
 
 
174 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  43.48 
 
 
174 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  43.48 
 
 
174 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  44.1 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  43.48 
 
 
174 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  43.48 
 
 
174 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  43.95 
 
 
178 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  43.48 
 
 
174 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 
194 aa  134  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  46.84 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  41.51 
 
 
175 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  41.25 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  41.25 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  41.25 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  41.25 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  40.62 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
173 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  39.05 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  38.22 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.65 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.81 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
192 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  39.87 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  39.64 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  34.68 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  37.87 
 
 
197 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.43 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  37.43 
 
 
175 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  33.15 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  35.88 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
199 aa  104  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.74 
 
 
197 aa  104  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  33.53 
 
 
194 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
204 aa  101  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  33.12 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
190 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 
108 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 
120 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  37.71 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  47.31 
 
 
108 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  44.79 
 
 
107 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  47.67 
 
 
108 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  50.59 
 
 
108 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  42.35 
 
 
118 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  49.4 
 
 
108 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  45.45 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  46.59 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 
142 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  39 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 
368 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  38.78 
 
 
368 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  34.71 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  37.21 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  45.21 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  44.44 
 
 
390 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  32.79 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
106 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.85 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.42 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.21 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.56 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  37.62 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.11 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  40.66 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.98 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
134 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3736  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571798  normal  0.0306844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>