More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1671 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  64.24 
 
 
477 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  100 
 
 
482 aa  992    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  67.29 
 
 
479 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  67.29 
 
 
479 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  54.38 
 
 
500 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.18 
 
 
302 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.13 
 
 
272 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.94 
 
 
272 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.57 
 
 
283 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  36.5 
 
 
270 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.95 
 
 
270 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
271 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.85 
 
 
270 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  27.29 
 
 
513 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.22 
 
 
275 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.51 
 
 
274 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.1 
 
 
288 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.1 
 
 
306 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.66 
 
 
267 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.67 
 
 
270 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  34.94 
 
 
274 aa  150  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  40.66 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.14 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 
274 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
284 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.82 
 
 
264 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.21 
 
 
274 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.29 
 
 
285 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
275 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
275 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.05 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.14 
 
 
274 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.87 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.1 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.29 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.73 
 
 
274 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.92 
 
 
281 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.66 
 
 
275 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.25 
 
 
275 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.44 
 
 
282 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.25 
 
 
275 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.25 
 
 
275 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 
276 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.25 
 
 
275 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.25 
 
 
275 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.2 
 
 
274 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.43 
 
 
275 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.43 
 
 
271 aa  136  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.89 
 
 
274 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.32 
 
 
276 aa  133  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.47 
 
 
287 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
192 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  34.24 
 
 
274 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.42 
 
 
274 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.09 
 
 
274 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.91 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.47 
 
 
273 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.27 
 
 
273 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.12 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.73 
 
 
272 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
173 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  31.54 
 
 
280 aa  126  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.62 
 
 
284 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.48 
 
 
264 aa  124  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  30.2 
 
 
276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.78 
 
 
266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
193 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.61 
 
 
283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.48 
 
 
279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
201 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
181 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
185 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
193 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
185 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
192 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
170 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
191 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
185 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.66 
 
 
300 aa  103  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.48 
 
 
187 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 
179 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
191 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
185 aa  99.8  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 
186 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
195 aa  97.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  28.68 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
317 aa  93.2  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
166 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
174 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30 
 
 
287 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.24 
 
 
309 aa  90.9  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>