158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1635 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
585 aa  1181    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  45.91 
 
 
692 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  41.72 
 
 
587 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  38.51 
 
 
584 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  36.36 
 
 
588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  35.98 
 
 
585 aa  302  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  36.03 
 
 
595 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  36.19 
 
 
568 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  34.96 
 
 
595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  36.38 
 
 
568 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  34.44 
 
 
608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.54 
 
 
1349 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.42 
 
 
1391 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.68 
 
 
1570 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.76 
 
 
580 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.38 
 
 
639 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.19 
 
 
584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  28.65 
 
 
579 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.71 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.15 
 
 
558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  24.84 
 
 
550 aa  97.4  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.3 
 
 
568 aa  97.4  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.32 
 
 
585 aa  97.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.59 
 
 
573 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.46 
 
 
569 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.35 
 
 
553 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.67 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  39.5 
 
 
143 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.22 
 
 
554 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  21.96 
 
 
569 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 
561 aa  83.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.11 
 
 
576 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.46 
 
 
567 aa  82.4  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.33 
 
 
585 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  25 
 
 
558 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.7 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  23.84 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.06 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.37 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  23.3 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  24.39 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.39 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.93 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.46 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  21.82 
 
 
562 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  23.33 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  21.79 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  24.65 
 
 
545 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  21.61 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.2 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.39 
 
 
607 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  21.61 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.46 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.56 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.18 
 
 
592 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  24.07 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.36 
 
 
591 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.34 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.3 
 
 
549 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.51 
 
 
557 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.21 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  22.35 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.12 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.28 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.36 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.43 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.58 
 
 
591 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.43 
 
 
692 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  21.47 
 
 
581 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  22.47 
 
 
570 aa  65.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22.39 
 
 
567 aa  63.5  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22.39 
 
 
567 aa  63.5  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  22.35 
 
 
576 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  22.97 
 
 
567 aa  63.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  24.14 
 
 
575 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.88 
 
 
559 aa  62.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.42 
 
 
561 aa  60.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.08 
 
 
553 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  22.22 
 
 
590 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  22.33 
 
 
583 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.86 
 
 
578 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  21.36 
 
 
550 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.33 
 
 
583 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.97 
 
 
565 aa  58.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  26.67 
 
 
554 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  22.86 
 
 
582 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  23.23 
 
 
553 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.12 
 
 
560 aa  57.4  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.21 
 
 
571 aa  57.4  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
541 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.73 
 
 
596 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.45 
 
 
608 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  22.73 
 
 
596 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  21.99 
 
 
548 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.61 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  20.99 
 
 
544 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  22.4 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  27.17 
 
 
570 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  20.48 
 
 
544 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  20.76 
 
 
590 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>