More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1585 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  100 
 
 
137 aa  276  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  79.56 
 
 
137 aa  226  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  78.83 
 
 
137 aa  224  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  72.26 
 
 
135 aa  200  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  73.72 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  62.04 
 
 
136 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  56.93 
 
 
131 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  56.93 
 
 
126 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  51.09 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.04 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.83 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.56 
 
 
295 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.41 
 
 
208 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  31.62 
 
 
306 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  30.15 
 
 
283 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  30.15 
 
 
283 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.37 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.67 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  30.88 
 
 
282 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.07 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.65 
 
 
207 aa  58.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  27.21 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.41 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.88 
 
 
288 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.06 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
283 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  26.92 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.57 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  32.86 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.78 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.16 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.86 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.2 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  53.7 
 
 
287 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  27.89 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.37 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
172 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  45 
 
 
283 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.94 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  40.51 
 
 
306 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  31.85 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.66 
 
 
286 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.58 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.09 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  48.15 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.47 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  28.28 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.61 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.61 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.74 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.37 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  25.69 
 
 
145 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  28.87 
 
 
140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.47 
 
 
150 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  32.37 
 
 
148 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.74 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.5 
 
 
287 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1334  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000527962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.38 
 
 
164 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.08 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  29.71 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.47 
 
 
180 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.57 
 
 
281 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.16 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  28.66 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.43 
 
 
307 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  24.36 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  24.36 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 
290 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  29.05 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.14 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>