53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1565 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  32.06 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  30.65 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  29.46 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  34.33 
 
 		 384 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  28.78 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  27.46 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  31.88 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1526 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  26.83 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  27.69 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  28.99 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  27.89 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.1 
 
 		 1016 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.1 
 
 		 1016 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  25.81 
 
 		 138 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  28.12 
 
 		 431 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 		 1656 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.48 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  24.44 
 
 		 404 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  32.11 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.26 
 
 		 1048 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  26.09 
 
 		 797 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5709  hypothetical protein  25.35 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000325929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  31.36 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  40.54 
 
 		 453 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  31.52 
 
 		 825 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.24 
 
 		 1348 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  27.18 
 
 		 570 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  26.72 
 
 		 378 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.93 
 
 		 1363 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  26.55 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  37.14 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  24.28 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0080  putative ATP/GTP binding protein  25.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.98 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  25.78 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  29.57 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  23.31 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.98 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  29.66 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  32.32 
 
 		 566 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.94 
 
 		 880 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.39 
 
 		 880 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  24.3 
 
 		 829 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  28.17 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  31.96 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  27.08 
 
 		 374 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  26.13 
 
 		 441 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>