248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1559 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  79.46 
 
 
448 aa  735    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
445 aa  907    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  79.46 
 
 
448 aa  735    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  68.69 
 
 
445 aa  634  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  68.54 
 
 
447 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  38.34 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  40.22 
 
 
463 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  38.53 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  37.25 
 
 
458 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  35.34 
 
 
491 aa  299  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  35.09 
 
 
464 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  34.26 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  37.96 
 
 
436 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  32.52 
 
 
446 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  32.12 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  33.76 
 
 
467 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  35.56 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  34.92 
 
 
476 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  34.28 
 
 
466 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  32.4 
 
 
446 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  33.05 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.99 
 
 
469 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  34.28 
 
 
443 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  33.86 
 
 
463 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  32.06 
 
 
437 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  32.06 
 
 
437 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  31.83 
 
 
437 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  32.68 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.69 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  32.68 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.72 
 
 
449 aa  210  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  32.47 
 
 
744 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.92 
 
 
455 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30.18 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  30.53 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  31.73 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  32.96 
 
 
441 aa  190  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.53 
 
 
445 aa  189  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  31.41 
 
 
412 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.17 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  31.07 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.85 
 
 
452 aa  183  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  32.55 
 
 
430 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.21 
 
 
472 aa  173  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  30.02 
 
 
418 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  31.16 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.13 
 
 
445 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  29.57 
 
 
411 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  32.59 
 
 
429 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  30.73 
 
 
394 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  30.1 
 
 
424 aa  156  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  30.02 
 
 
412 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  30.68 
 
 
420 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  30 
 
 
421 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  30.7 
 
 
410 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  30.02 
 
 
415 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  26.87 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  26.87 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  26.64 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  29.6 
 
 
417 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  28.25 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  27.27 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  27.76 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  26.98 
 
 
425 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  26.38 
 
 
408 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  26.65 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  25.93 
 
 
470 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.64 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.69 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.9 
 
 
491 aa  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.13 
 
 
489 aa  63.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  26.97 
 
 
401 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.87 
 
 
493 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3633  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  23.41 
 
 
458 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0676  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.03 
 
 
462 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  25 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.77 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0773  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  25.09 
 
 
486 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.03528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1956  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  26.79 
 
 
490 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  24.82 
 
 
492 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.51 
 
 
473 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6976  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  24.43 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.282447  hitchhiker  0.0000349353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1111  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.63 
 
 
472 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.27 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0359  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.36 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1056  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.73 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  24.02 
 
 
449 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3825  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  26.92 
 
 
462 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04321  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  21.14 
 
 
511 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3909  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  26.92 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08860  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  29.08 
 
 
464 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0311093  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0752  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.03 
 
 
476 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3293  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  30.19 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2866  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide synthase  26.67 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00476658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.3 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2093  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  29.63 
 
 
447 aa  53.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2791  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  23.51 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2872  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.19 
 
 
468 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.647989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0669  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.92 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0408  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  21.45 
 
 
511 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.966635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>