More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1554 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 366 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2534  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.35 
 
 		 360 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.113994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.35 
 
 		 360 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.63 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1892  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.66 
 
 		 371 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2503  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.12 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.54699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  69.5 
 
 		 375 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.35 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.06 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01931  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.95 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.81 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.36 
 
 		 338 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.77 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.45 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.26 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.19 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.39 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.93 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.23 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.9 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.72 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 336 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 336 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.62 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.75 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.53 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.76 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.93 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.63 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.74 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  55.56 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.27 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.67 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.47 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.46 
 
 		 356 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0140  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.52 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.52 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.31 
 
 		 353 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.35 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.17 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.65 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.41 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.75 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.51 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.94 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.73 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>