More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1540 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01691  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  65.54 
 
 
531 aa  705  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.588128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5216  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  76.17 
 
 
531 aa  824  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0292  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  66.04 
 
 
548 aa  686  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26711  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  66.42 
 
 
563 aa  694  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4450  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.86 
 
 
526 aa  886  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.487224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0659  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.79 
 
 
527 aa  879  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.79601  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1516  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  67.86 
 
 
538 aa  700  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01671  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  65.23 
 
 
534 aa  704  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02221  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  68.06 
 
 
538 aa  700  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  60.46 
 
 
537 aa  654  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01781  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  65.29 
 
 
546 aa  680  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2401  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  70.26 
 
 
533 aa  715  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  59.66 
 
 
532 aa  639  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.63526e-09 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  59.33 
 
 
534 aa  655  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  100 
 
 
537 aa  1081  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  80.11 
 
 
524 aa  874  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4388  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.86 
 
 
526 aa  886  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1745  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  80.11 
 
 
525 aa  883  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1976  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  76.39 
 
 
534 aa  821  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.304394 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0152  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  65.67 
 
 
534 aa  702  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01651  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  64.35 
 
 
558 aa  673  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2308  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  57.75 
 
 
561 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1439  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  58.54 
 
 
533 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4656  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  57.3 
 
 
561 aa  612  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000336952 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.72 
 
 
560 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.54 
 
 
560 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  56.72 
 
 
561 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  56.04 
 
 
563 aa  584  1e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18571  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.25 
 
 
523 aa  508  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.960985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  48.55 
 
 
523 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.39 
 
 
524 aa  492  1e-138  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0594  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  50 
 
 
512 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.926621  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  51.39 
 
 
524 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1030  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  55.53 
 
 
511 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06501  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  49.81 
 
 
513 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06201  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  49.23 
 
 
513 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.347032  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06591  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  50.59 
 
 
512 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0931  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  50 
 
 
504 aa  465  1e-130  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.743179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.94 
 
 
506 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1007  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.84 
 
 
527 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.244989  normal  0.172272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.38 
 
 
527 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.38 
 
 
527 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.46 
 
 
507 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.55 
 
 
503 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  37.94 
 
 
501 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.01 
 
 
506 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  36.49 
 
 
502 aa  325  9e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.41 
 
 
497 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.51 
 
 
495 aa  324  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  34.57 
 
 
522 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  36.29 
 
 
502 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.06 
 
 
519 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  35.78 
 
 
502 aa  322  1e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  38.19 
 
 
505 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.53 
 
 
517 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2047  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.57 
 
 
506 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.688388  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.36 
 
 
503 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  36.31 
 
 
513 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.8 
 
 
525 aa  315  1e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  38.38 
 
 
503 aa  315  2e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.01 
 
 
510 aa  314  3e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  37.55 
 
 
505 aa  312  8e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  35.77 
 
 
513 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.08 
 
 
545 aa  310  3e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  34.19 
 
 
489 aa  310  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  36.47 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  35.66 
 
 
496 aa  309  7e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.66 
 
 
509 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  37.31 
 
 
503 aa  308  1e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
496 aa  308  1e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0816  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.25 
 
 
497 aa  308  1e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  36.35 
 
 
512 aa  308  2e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  36.08 
 
 
496 aa  308  2e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  36.44 
 
 
505 aa  308  2e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  38.25 
 
 
488 aa  308  2e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  35.66 
 
 
496 aa  308  2e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  35.56 
 
 
497 aa  307  4e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  35.7 
 
 
514 aa  306  5e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0933  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.67 
 
 
505 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1103  NADH dehydrogenase subunit M  35.9 
 
 
495 aa  305  1e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.54 
 
 
504 aa  304  2e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.77 
 
 
504 aa  305  2e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.06 
 
 
507 aa  305  2e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  33.01 
 
 
504 aa  304  3e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34 
 
 
545 aa  303  4e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.3 
 
 
535 aa  303  5e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.69 
 
 
545 aa  303  6e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  34.27 
 
 
513 aa  302  8e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>