More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1523 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  42.08 
 
 
789 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  67.99 
 
 
896 aa  833    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 
804 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  60.53 
 
 
896 aa  834    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
808 aa  1634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
760 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  42.77 
 
 
752 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  41.53 
 
 
793 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  43.11 
 
 
764 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.06 
 
 
764 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  42.54 
 
 
769 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  42.87 
 
 
769 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  42.54 
 
 
769 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.77 
 
 
763 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
769 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
755 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
766 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  49.22 
 
 
832 aa  582  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  46.97 
 
 
864 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  46.97 
 
 
864 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  46.97 
 
 
864 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  46.97 
 
 
864 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  46.97 
 
 
864 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  46.97 
 
 
864 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  48.46 
 
 
1079 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
769 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
765 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  45.39 
 
 
768 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
762 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  48.27 
 
 
769 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 
767 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  48.27 
 
 
769 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
742 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  29.09 
 
 
878 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.02 
 
 
734 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
741 aa  324  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
740 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27.91 
 
 
769 aa  318  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.15 
 
 
769 aa  317  8e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
784 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
762 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  27.89 
 
 
769 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  28.55 
 
 
777 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.48 
 
 
770 aa  302  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  36.08 
 
 
764 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.72 
 
 
774 aa  291  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.95 
 
 
803 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
679 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
2539 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
974 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
679 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.5 
 
 
2301 aa  286  9e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.23 
 
 
2336 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  28.67 
 
 
1987 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.84 
 
 
1992 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
1974 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.09 
 
 
1971 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
686 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.68 
 
 
785 aa  280  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
777 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
1065 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.09 
 
 
783 aa  278  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
952 aa  277  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.1 
 
 
2458 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.1 
 
 
2476 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
1012 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
801 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
705 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
705 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
777 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
783 aa  272  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  26.72 
 
 
798 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
1127 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.63 
 
 
2284 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1646 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  31.33 
 
 
770 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1646 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
772 aa  271  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
989 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
989 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.79 
 
 
1866 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
756 aa  270  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
706 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
865 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
865 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
1647 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
781 aa  267  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
2423 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  30.82 
 
 
839 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
1609 aa  265  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
1629 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
750 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
681 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
756 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
1098 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
753 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
1098 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
695 aa  259  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
1616 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
977 aa  256  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>