71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1507 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 
825 aa  1676    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.45 
 
 
880 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.57 
 
 
880 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  35.5 
 
 
778 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  44.21 
 
 
1016 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  44.21 
 
 
1016 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  38.26 
 
 
947 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  40.64 
 
 
402 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  42.21 
 
 
1048 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  32.11 
 
 
447 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  39.44 
 
 
1348 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  36.2 
 
 
1279 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  36.2 
 
 
1279 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  37.98 
 
 
1363 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  34.82 
 
 
1373 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.59 
 
 
1656 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  28.1 
 
 
544 aa  98.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.55 
 
 
778 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  26.9 
 
 
715 aa  87.4  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  28.47 
 
 
1046 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  37.3 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  20.63 
 
 
737 aa  72  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 
800 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4531  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.65 
 
 
747 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  21.16 
 
 
841 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  21.3 
 
 
721 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  29.68 
 
 
570 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  21.03 
 
 
844 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4040  hypothetical protein  59.18 
 
 
72 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.980634  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  28.7 
 
 
138 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.18 
 
 
725 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  30.77 
 
 
598 aa  55.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  29.32 
 
 
960 aa  55.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.61 
 
 
649 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.63 
 
 
517 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.47 
 
 
908 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.17 
 
 
762 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.17 
 
 
762 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.57 
 
 
799 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4464  hypothetical protein  31.87 
 
 
161 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.23 
 
 
805 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  26.95 
 
 
1186 aa  52.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  26.44 
 
 
485 aa  51.2  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.15 
 
 
1438 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.44 
 
 
951 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
1818 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.44 
 
 
1611 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  25.16 
 
 
291 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  34.12 
 
 
796 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  29.2 
 
 
500 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
406 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
406 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  30.11 
 
 
286 aa  47.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  29.27 
 
 
773 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  31.52 
 
 
290 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  27.68 
 
 
137 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.36 
 
 
1150 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  28.68 
 
 
303 aa  47  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.4 
 
 
490 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  36.26 
 
 
398 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  23.74 
 
 
637 aa  45.8  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.26 
 
 
398 aa  45.4  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  29.69 
 
 
384 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.92 
 
 
911 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  25 
 
 
374 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  36.25 
 
 
272 aa  44.3  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 
845 aa  44.3  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
1283 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.64 
 
 
852 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.58 
 
 
766 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>