102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1501 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 
641 aa  1298  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.95418e-24 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  55.88 
 
 
666 aa  672  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  4.73343e-05  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  55.88 
 
 
666 aa  672  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  44.05 
 
 
533 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  44.55 
 
 
574 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  3.93409e-11  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  43.25 
 
 
639 aa  465  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  43.06 
 
 
561 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  7.85609e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  43.05 
 
 
551 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  39.12 
 
 
591 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  40.7 
 
 
550 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  38.47 
 
 
593 aa  358  1e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  38.74 
 
 
563 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  6.60522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  35.52 
 
 
581 aa  308  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  35.52 
 
 
581 aa  308  2e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  35.96 
 
 
586 aa  305  1e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  35.96 
 
 
586 aa  306  1e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  35.16 
 
 
604 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  34.9 
 
 
581 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  8.41951e-11  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  34.81 
 
 
529 aa  296  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  49.3 
 
 
645 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  49.01 
 
 
632 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  35.21 
 
 
530 aa  283  5e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  32.24 
 
 
600 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  35.05 
 
 
572 aa  277  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  33.08 
 
 
539 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  33.08 
 
 
542 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  36.55 
 
 
622 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  39.91 
 
 
531 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  36.05 
 
 
491 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  31.95 
 
 
658 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  3.90313e-05  unclonable  2.85099e-10 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.95 
 
 
624 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  32.81 
 
 
571 aa  235  2e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  35.14 
 
 
548 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  34.17 
 
 
543 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  35.75 
 
 
550 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  32.04 
 
 
606 aa  214  4e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  32.62 
 
 
643 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  9.00458e-06  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  33.26 
 
 
589 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  48.57 
 
 
531 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  5.40569e-06  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  54.92 
 
 
518 aa  195  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.07 
 
 
510 aa  181  3e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  43.82 
 
 
578 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  43.7 
 
 
524 aa  165  2e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  40.15 
 
 
543 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  42.38 
 
 
513 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  47.42 
 
 
629 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  1.42849e-05  unclonable  4.25549e-10 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  48.33 
 
 
518 aa  157  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  32.35 
 
 
508 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  41.96 
 
 
514 aa  156  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  40.96 
 
 
500 aa  156  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  38.32 
 
 
531 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  46.23 
 
 
475 aa  153  9e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  39.38 
 
 
555 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  45.73 
 
 
561 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  41.59 
 
 
528 aa  151  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  40.23 
 
 
568 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  43.41 
 
 
527 aa  132  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  41.21 
 
 
188 aa  131  4e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  39.2 
 
 
544 aa  130  8e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  44.44 
 
 
261 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  67.16 
 
 
262 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  67.16 
 
 
262 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  31.23 
 
 
515 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  30.86 
 
 
515 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  28.63 
 
 
450 aa  85.1  3e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  5.55529e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  41.24 
 
 
946 aa  71.2  5e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  30.97 
 
 
485 aa  70.9  7e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  3.76078e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.17 
 
 
449 aa  68.9  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.3 
 
 
440 aa  68.6  3e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.29 
 
 
416 aa  67  1e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  37.38 
 
 
932 aa  66.6  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  1.40027e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  36.54 
 
 
919 aa  60.5  1e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  3.09483e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  33.33 
 
 
186 aa  58.2  5e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.85925e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  36.44 
 
 
673 aa  56.6  2e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  34.83 
 
 
255 aa  55.1  4e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  41.56 
 
 
415 aa  55.1  4e-06  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.69 
 
 
361 aa  54.3  6e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 
343 aa  54.3  8e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  3.42894e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  36.26 
 
 
432 aa  53.5  1e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  35 
 
 
437 aa  53.1  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  38.95 
 
 
424 aa  52.8  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  27.92 
 
 
784 aa  52  3e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  49.02 
 
 
575 aa  51.6  4e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40.62 
 
 
1821 aa  51.2  5e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  33.88 
 
 
426 aa  50.8  8e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  34.41 
 
 
432 aa  50.4  9e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.97 
 
 
330 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  46.67 
 
 
1036 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  40.68 
 
 
400 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  6.1041e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  42.11 
 
 
506 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  40.68 
 
 
400 aa  48.5  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.89503e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  48.89 
 
 
548 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  32.73 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  34.88 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  35.48 
 
 
441 aa  46.6  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.17367e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  35.09 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  35.09 
 
 
403 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  9.1055e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  51.28 
 
 
457 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  40 
 
 
413 aa  44.3  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  39.13 
 
 
468 aa  43.9  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  4.98121e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>