More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1488 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
357 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  77.53 
 
 
357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  77.81 
 
 
357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  74.58 
 
 
358 aa  542  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  75 
 
 
357 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.25 
 
 
364 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.1 
 
 
356 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.06 
 
 
355 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.78 
 
 
355 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.49 
 
 
354 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.98 
 
 
355 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.54 
 
 
358 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.82 
 
 
355 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.11 
 
 
355 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.3 
 
 
356 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.4 
 
 
355 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.4 
 
 
355 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
356 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
358 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
357 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.98 
 
 
355 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.14 
 
 
376 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.47 
 
 
359 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.61 
 
 
355 aa  355  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  354  1e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  49.16 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.9 
 
 
355 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.67 
 
 
357 aa  328  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.52 
 
 
355 aa  316  5e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.45 
 
 
357 aa  315  9e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.4 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.58 
 
 
354 aa  299  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.17 
 
 
358 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.01 
 
 
354 aa  279  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.06 
 
 
355 aa  275  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.02 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.07 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.47 
 
 
351 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.76 
 
 
397 aa  210  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  37.98 
 
 
396 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.27 
 
 
245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.46 
 
 
245 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.87 
 
 
245 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
245 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
245 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
245 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  38.06 
 
 
245 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
245 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  37.65 
 
 
245 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.77 
 
 
296 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.93 
 
 
405 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.14 
 
 
400 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36 
 
 
400 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  39.02 
 
 
253 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.27 
 
 
243 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.71 
 
 
400 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.35 
 
 
296 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.99 
 
 
294 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.99 
 
 
296 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.1 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.76 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.99 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.23 
 
 
296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.99 
 
 
296 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.41 
 
 
235 aa  173  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.99 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
307 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 
299 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
291 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
298 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2318  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
297 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.83 
 
 
294 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
291 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
295 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.68 
 
 
312 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.76 
 
 
293 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
295 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.33 
 
 
291 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3013  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.35 
 
 
296 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  hitchhiker  0.00164401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2557  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.51 
 
 
287 aa  169  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0967265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
297 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
405 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
297 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  39.33 
 
 
294 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
257 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
290 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02720  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 
307 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
297 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
298 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  39.33 
 
 
294 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.62 
 
 
293 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.57 
 
 
302 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
292 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1753  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.26 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0064  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.08 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>