41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1444 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  86.07 
 
 		 126 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  86.07 
 
 		 126 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  82.46 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  81.58 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  80.87 
 
 		 121 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  79.82 
 
 		 137 aa  190  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  60.63 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  54.62 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  55.83 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  55.83 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  54.17 
 
 		 125 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  55.26 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  52.89 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  57.66 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  57.66 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  57.66 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  52.89 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  52.21 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  53.04 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  50.41 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  55.86 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  53.91 
 
 		 129 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  52.89 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  49.22 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  52.25 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  52.25 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  49.59 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  52.07 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  46.73 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  47.71 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  45.87 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  45.87 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  43.93 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  44.86 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  42.99 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  39.25 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  39.05 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>