122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1384 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  377  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  52.63 
 
 
184 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  48.52 
 
 
178 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  50.6 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  49.1 
 
 
175 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  45.29 
 
 
179 aa  174  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  50.59 
 
 
175 aa  174  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  47.78 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  45.88 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  50.3 
 
 
164 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  46.75 
 
 
179 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  48.28 
 
 
179 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  50.62 
 
 
161 aa  167  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  46.99 
 
 
178 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  45.14 
 
 
176 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  45.78 
 
 
191 aa  164  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  46.02 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  47.9 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  46.95 
 
 
176 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  43.65 
 
 
179 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  44.58 
 
 
177 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  47.8 
 
 
187 aa  158  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  46.78 
 
 
191 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  55.04 
 
 
133 aa  151  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  43.98 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  41.57 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  41.92 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  46 
 
 
161 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  40.36 
 
 
163 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  40.12 
 
 
178 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  30.38 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.31 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.86 
 
 
205 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  27.66 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  25.76 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  22.29 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  28.17 
 
 
177 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  27.46 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  21.99 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  51.2  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  20.86 
 
 
1372 aa  51.2  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  22.54 
 
 
160 aa  50.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  31.15 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  21.43 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  23.02 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  26.06 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  23.85 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  23.19 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  23.53 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  23.02 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  23.53 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  21.01 
 
 
152 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  25.64 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25.33 
 
 
152 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  25.52 
 
 
196 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  24.14 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.4 
 
 
1345 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  22.46 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.43 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  25.86 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  21.26 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  24 
 
 
223 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  21.43 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  29.73 
 
 
258 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  23.73 
 
 
197 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  24.67 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  21.05 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  26.27 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  25.68 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  25.35 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  33.93 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  19.86 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  45.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  26.36 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1096  transposase  25.86 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  27.52 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  23.36 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  24.34 
 
 
287 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  26.89 
 
 
240 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  23.44 
 
 
235 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0459  transposase  25.64 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  25.68 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  36.07 
 
 
58 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  25.44 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  26.32 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  20.74 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  27.42 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  21.43 
 
 
316 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  26.87 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>