More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1301 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  73.85 
 
 
131 aa  203  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  73.85 
 
 
131 aa  203  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  73.23 
 
 
132 aa  197  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 
227 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 
130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  59.06 
 
 
130 aa  165  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  63.85 
 
 
134 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 
126 aa  148  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  54.62 
 
 
130 aa  146  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  52.31 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  50.77 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  53.85 
 
 
129 aa  144  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  57.81 
 
 
125 aa  143  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 
127 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  54.4 
 
 
126 aa  141  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 
124 aa  140  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 
124 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  51.54 
 
 
132 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  52.8 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
126 aa  137  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
126 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
135 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  51.59 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
127 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  54.76 
 
 
156 aa  134  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  51.16 
 
 
132 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  52.8 
 
 
127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 
129 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
125 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 
126 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
126 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 
122 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
126 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 
126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 
124 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  52.38 
 
 
125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 
124 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
129 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  52.42 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 
125 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
128 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 
126 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 
124 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  122  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 
124 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
126 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 
129 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
128 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
128 aa  121  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
125 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 
122 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
127 aa  121  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 
125 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
128 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 
125 aa  120  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
127 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
126 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 
126 aa  120  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
126 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  50.78 
 
 
129 aa  120  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
128 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
128 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
128 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>