More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1257 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.76 
 
 
249 aa  214  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  1.45051e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.76 
 
 
249 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.8 
 
 
261 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
260 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  43.75 
 
 
334 aa  139  5e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  39.7 
 
 
581 aa  138  8e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.18 
 
 
406 aa  134  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.18 
 
 
406 aa  134  1e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.85 
 
 
706 aa  133  2e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  41.52 
 
 
462 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  41.32 
 
 
706 aa  130  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  43.75 
 
 
582 aa  130  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.71 
 
 
1022 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 
649 aa  127  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.19 
 
 
1056 aa  127  2e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.49 
 
 
988 aa  126  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  39.77 
 
 
539 aa  126  4e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  39.77 
 
 
306 aa  125  4e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.26 
 
 
818 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
271 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
306 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
331 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
392 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.26 
 
 
784 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.35 
 
 
746 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.99 
 
 
233 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 
547 aa  119  5e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.35 
 
 
1056 aa  117  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 
361 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31061e-06 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
240 aa  115  7e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.25 
 
 
542 aa  114  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
605 aa  112  4e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.93 
 
 
820 aa  111  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
404 aa  111  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
308 aa  110  2e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
1421 aa  110  2e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
1276 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.14 
 
 
1240 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  34.94 
 
 
750 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.2 
 
 
357 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 
1827 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 
352 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 
308 aa  108  7e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
349 aa  108  7e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
279 aa  108  7e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
280 aa  108  9e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.35 
 
 
373 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
280 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
239 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
306 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 
471 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.29 
 
 
738 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.2 
 
 
458 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
371 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
499 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  36.69 
 
 
267 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
304 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
301 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.15 
 
 
340 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 
284 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.3055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
927 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
617 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 
219 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
446 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
291 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
878 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
428 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
270 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
342 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  33.55 
 
 
442 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  29.67 
 
 
415 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
909 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
3560 aa  98.6  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
305 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  32.84 
 
 
269 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
543 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
391 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
3035 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
452 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
685 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
739 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.53 
 
 
629 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.01 
 
 
725 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 
301 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 
187 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
422 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 
369 aa  95.5  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
762 aa  95.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
4489 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.48 
 
 
1007 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
750 aa  93.6  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
515 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.84 
 
 
1694 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.44 
 
 
810 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>