85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1250 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  100 
 
 
849 aa  1743    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
1067 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.64 
 
 
1366 aa  294  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
1044 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  45.7 
 
 
857 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  53.25 
 
 
1152 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  53.85 
 
 
1152 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.91 
 
 
2796 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  43.55 
 
 
2342 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  43.55 
 
 
2342 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.08 
 
 
1806 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  40.08 
 
 
1632 aa  184  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 
872 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
756 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
665 aa  149  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 
1247 aa  149  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
1313 aa  148  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
1322 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  43.5 
 
 
746 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  43.71 
 
 
521 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
995 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  44.29 
 
 
535 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
1059 aa  131  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
1035 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  41.71 
 
 
597 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
987 aa  121  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.33 
 
 
916 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
1264 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  34.54 
 
 
235 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  43.8 
 
 
518 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 
361 aa  104  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  34.95 
 
 
223 aa  102  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  42.75 
 
 
294 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  44.27 
 
 
294 aa  101  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  44.27 
 
 
294 aa  101  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  49.12 
 
 
361 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  40.8 
 
 
678 aa  100  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
361 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
995 aa  99.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  43.22 
 
 
305 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 
1317 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
882 aa  88.6  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  47.25 
 
 
592 aa  88.2  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 
1476 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  32.95 
 
 
462 aa  87  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  57.75 
 
 
115 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  54.93 
 
 
120 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
1075 aa  84.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.68 
 
 
418 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  48.75 
 
 
255 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  51.28 
 
 
137 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  50.7 
 
 
227 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  45.24 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 
830 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  41.38 
 
 
644 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 
1301 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  26.44 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 
2296 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  27.05 
 
 
736 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  35.66 
 
 
1880 aa  70.1  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  40.94 
 
 
1313 aa  70.1  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.19 
 
 
1161 aa  69.3  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  46.58 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  50.68 
 
 
1302 aa  67.8  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  37.4 
 
 
322 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
814 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  52.08 
 
 
399 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  37.63 
 
 
751 aa  60.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.63 
 
 
751 aa  60.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.96 
 
 
1162 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  40.26 
 
 
1236 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 
846 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  25.93 
 
 
4697 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  42.17 
 
 
133 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  37.8 
 
 
603 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
828 aa  48.9  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  34.65 
 
 
1805 aa  48.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  28.33 
 
 
287 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
801 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  27.41 
 
 
769 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  47.46 
 
 
668 aa  45.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  43.18 
 
 
296 aa  44.3  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
1334 aa  44.3  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>