More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1234 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.17 
 
 		 1247 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1188 aa  2430    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  32.78 
 
 		 1188 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  43.03 
 
 		 1193 aa  977    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.82 
 
 		 1208 aa  757    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 1221 aa  890    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  42.07 
 
 		 1196 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  40.05 
 
 		 1190 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  42.16 
 
 		 1213 aa  968    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  33.22 
 
 		 1209 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  41.41 
 
 		 1474 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.52 
 
 		 1443 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  46.48 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.03 
 
 		 1411 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  42.64 
 
 		 1652 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  42.11 
 
 		 1163 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  41.65 
 
 		 1363 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 		 1557 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.66 
 
 		 1523 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  42.74 
 
 		 1236 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  41.91 
 
 		 947 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  44.16 
 
 		 566 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.39 
 
 		 1868 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  38.11 
 
 		 1454 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  42.93 
 
 		 1364 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  35.3 
 
 		 1831 aa  426  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  38.07 
 
 		 1553 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  39.75 
 
 		 1789 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.82 
 
 		 1686 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  37.56 
 
 		 1510 aa  406  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.57 
 
 		 1357 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.71 
 
 		 1481 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.45 
 
 		 1711 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  38.26 
 
 		 1211 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  37.82 
 
 		 919 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  34.81 
 
 		 1552 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.48 
 
 		 1262 aa  376  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.79 
 
 		 930 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34 
 
 		 1901 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.52 
 
 		 1760 aa  359  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.15 
 
 		 1217 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1229 aa  353  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  40.34 
 
 		 1656 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1367 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.39 
 
 		 1547 aa  342  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1807 aa  341  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.13 
 
 		 1348 aa  341  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.54 
 
 		 1280 aa  340  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1661 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  35.04 
 
 		 1177 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  38.26 
 
 		 1714 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.21 
 
 		 1609 aa  330  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1176 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.5 
 
 		 1598 aa  326  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  35.2 
 
 		 1161 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  35.03 
 
 		 1161 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.53 
 
 		 1583 aa  317  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.19 
 
 		 1617 aa  310  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.45 
 
 		 1626 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.64 
 
 		 1607 aa  307  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  31.57 
 
 		 728 aa  307  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1214 aa  299  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  33.11 
 
 		 1242 aa  297  7e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.2 
 
 		 1684 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.98 
 
 		 1599 aa  293  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  32.42 
 
 		 1209 aa  291  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.85 
 
 		 1416 aa  290  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.88 
 
 		 1766 aa  290  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.1 
 
 		 1344 aa  287  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.34 
 
 		 1330 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.78 
 
 		 924 aa  280  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  32.57 
 
 		 1373 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.05 
 
 		 1823 aa  276  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 		 1016 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 		 1016 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.39 
 
 		 1267 aa  275  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 		 1623 aa  271  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.03 
 
 		 608 aa  268  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.74 
 
 		 1856 aa  266  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  41.88 
 
 		 344 aa  264  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.99 
 
 		 1599 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  29.26 
 
 		 505 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  31.72 
 
 		 1484 aa  259  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.52 
 
 		 676 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.04 
 
 		 740 aa  258  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 1878 aa  257  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1304 aa  254  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1041 aa  250  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.12 
 
 		 1164 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  41.03 
 
 		 344 aa  249  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.6 
 
 		 1039 aa  249  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1657 aa  247  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  34.74 
 
 		 471 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.87 
 
 		 677 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.64 
 
 		 1240 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1399 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  31.18 
 
 		 565 aa  241  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.24 
 
 		 1858 aa  238  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 		 1264 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 		 1264 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>