More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1167 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  49.2 
 
 
947 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.62 
 
 
1209 aa  711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  52.44 
 
 
1236 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  41.28 
 
 
1161 aa  843    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  40.18 
 
 
1177 aa  800    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  36.05 
 
 
1190 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  40.76 
 
 
1164 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  45.92 
 
 
1652 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  40.55 
 
 
1176 aa  814    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  41.2 
 
 
1161 aa  841    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  40.05 
 
 
1367 aa  899    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1163 aa  2381    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  57.1 
 
 
1363 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  39.48 
 
 
891 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.37 
 
 
1686 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  49.13 
 
 
1553 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  46.89 
 
 
696 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.15 
 
 
1481 aa  554  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  43.23 
 
 
1789 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  42.88 
 
 
1523 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  43.64 
 
 
1510 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.02 
 
 
1760 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  40.03 
 
 
1552 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  51.72 
 
 
1364 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.32 
 
 
1711 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  47.44 
 
 
1221 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.98 
 
 
1557 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 
1474 aa  505  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  48.55 
 
 
1443 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  41.49 
 
 
1454 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  42.11 
 
 
1188 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  47.02 
 
 
1196 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  43.65 
 
 
1868 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  40.77 
 
 
1193 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  44.99 
 
 
919 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.64 
 
 
1357 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  43.17 
 
 
1661 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  43.81 
 
 
1229 aa  463  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.34 
 
 
1262 aa  460  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  46.41 
 
 
1656 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  35.08 
 
 
1831 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  50.54 
 
 
902 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  50.54 
 
 
902 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  40.75 
 
 
1247 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  38.08 
 
 
1714 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.31 
 
 
1609 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.96 
 
 
1858 aa  429  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.19 
 
 
1547 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 
1190 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.78 
 
 
930 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.85 
 
 
1598 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.55 
 
 
1626 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  37.48 
 
 
1348 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.51 
 
 
1583 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.94 
 
 
1217 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  36.26 
 
 
1211 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  53.07 
 
 
1908 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  52.05 
 
 
781 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  35.85 
 
 
1213 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.28 
 
 
1617 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.66 
 
 
1901 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.71 
 
 
924 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  45.81 
 
 
1477 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  35.76 
 
 
1208 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.14 
 
 
1684 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.84 
 
 
1607 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.5 
 
 
1599 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  35.25 
 
 
1373 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  50.53 
 
 
1914 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  49.18 
 
 
2077 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  36.74 
 
 
728 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  35.32 
 
 
1264 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  35.32 
 
 
1264 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  34.76 
 
 
1416 aa  365  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.76 
 
 
1016 aa  357  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.76 
 
 
1016 aa  356  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  51.07 
 
 
335 aa  353  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  32.76 
 
 
1242 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  35.44 
 
 
1280 aa  351  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.81 
 
 
1807 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.9 
 
 
1623 aa  347  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.28 
 
 
1344 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.42 
 
 
1267 aa  342  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  34.3 
 
 
1188 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  53.33 
 
 
344 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.14 
 
 
1304 aa  335  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  46.07 
 
 
1932 aa  333  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  52.44 
 
 
344 aa  330  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 
1766 aa  329  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  44.85 
 
 
1599 aa  329  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.15 
 
 
740 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  36.05 
 
 
1411 aa  324  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.61 
 
 
1214 aa  323  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  36.75 
 
 
505 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  31.11 
 
 
1484 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.56 
 
 
1856 aa  319  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.39 
 
 
1330 aa  315  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  45.95 
 
 
1878 aa  313  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  53.54 
 
 
676 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  36.03 
 
 
1311 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>