More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1155 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  73.13 
 
 
529 aa  808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  70.99 
 
 
527 aa  781    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  63.19 
 
 
524 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  71.24 
 
 
522 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  100 
 
 
522 aa  1075    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  71.91 
 
 
529 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  66.92 
 
 
529 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  68.35 
 
 
533 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  63.39 
 
 
524 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  55.69 
 
 
529 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  53.62 
 
 
533 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  53.79 
 
 
525 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  53.89 
 
 
523 aa  553  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  41.01 
 
 
504 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  40.61 
 
 
503 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
504 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  39.53 
 
 
503 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 
561 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  39.68 
 
 
503 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 
600 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  39.48 
 
 
509 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 
504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  40.28 
 
 
498 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
512 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  38.88 
 
 
500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 
498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 
502 aa  355  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  39.28 
 
 
493 aa  354  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  39.2 
 
 
520 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 
502 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.6 
 
 
546 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 
501 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 
490 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 
521 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 
534 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  32.51 
 
 
528 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.31 
 
 
527 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.4 
 
 
528 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  34.39 
 
 
527 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 
539 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 
527 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 
546 aa  282  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 
553 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
547 aa  280  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  33.69 
 
 
547 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  34.8 
 
 
547 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 
543 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 
547 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
531 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.85 
 
 
527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 
542 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  31.86 
 
 
523 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  35.85 
 
 
532 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
527 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  29.81 
 
 
430 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 
428 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
429 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.1 
 
 
428 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  28.76 
 
 
444 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
446 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 
471 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 
471 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
459 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  27.46 
 
 
428 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 
462 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 
449 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
448 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27 
 
 
434 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.64 
 
 
441 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
477 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.22 
 
 
479 aa  126  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 
473 aa  123  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 
470 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.5 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 
472 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 
434 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.21 
 
 
478 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  22.58 
 
 
495 aa  118  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 
477 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 
476 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25 
 
 
468 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
473 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 
459 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>