57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1137 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1137  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  244  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4775  hypothetical protein  54.87 
 
 
120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.39699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2250  hypothetical protein  53.1 
 
 
116 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0342  hypothetical protein  53.21 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0322  hypothetical protein  53.21 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0085  hypothetical protein  49.56 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0975  hypothetical protein  53.98 
 
 
127 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1490  hypothetical protein  55.17 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1388  hypothetical protein  50.43 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2241  hypothetical protein  45.83 
 
 
121 aa  104  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3673  hypothetical protein  44.83 
 
 
125 aa  103  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00348463  normal  0.213574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0989  hypothetical protein  48.62 
 
 
125 aa  103  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1699  hypothetical protein  46.61 
 
 
117 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2241  hypothetical protein  46.96 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.604534  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1034  hypothetical protein  53.16 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0627  hypothetical protein  46.91 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0507  hypothetical protein  36.84 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4626  hypothetical protein  44.57 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0398  hypothetical protein  30.08 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4173  hypothetical protein  33.96 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0452  hypothetical protein  49.28 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2918  hypothetical protein  39.6 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1554  S23 ribosomal protein  28.85 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2527  hypothetical protein  26.36 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5056  hypothetical protein  30.1 
 
 
120 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3674  S23 ribosomal protein  26.61 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1641  hypothetical protein  29.91 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1893  hypothetical protein  32.38 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237674  hitchhiker  0.00834081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2230  hypothetical protein  28.85 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.8637e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1768  S23 ribosomal protein  29.21 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.392074  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0510  S23 ribosomal protein  30.95 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426974  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1831  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  47.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4365  S23 ribosomal  22.32 
 
 
127 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.981218  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2958  hypothetical protein  27.52 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4875  S23 ribosomal protein  29.66 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3761  S23 ribosomal protein  30.49 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1973  S23 ribosomal protein  26.97 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.174055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0008  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0176  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.713236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1260  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1266  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2021  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.933908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2947  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  35.29 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1904  S23 ribosomal protein  26.97 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3269  hypothetical protein  28.38 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2528  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2996  hypothetical protein  31.19 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1903  S23 ribosomal protein  26.32 
 
 
117 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.452499  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0405  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.743042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  28.32 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1770  hypothetical protein  26.13 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00388506  normal  0.0836423 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2609  S23 ribosomal protein  28.74 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.839204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>