More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1113 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 723 aa  1481    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 941 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 1560 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 2693 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1274 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 792 aa  240  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 572 aa  238  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 		 964 aa  237  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  52.88 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 		 1714 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.56 
 
 		 664 aa  217  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 834 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 1183 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 488 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  46.85 
 
 		 783 aa  206  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 1654 aa  205  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 		 714 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 1093 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 1093 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 767 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 		 815 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  46.3 
 
 		 1239 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  45.33 
 
 		 744 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 945 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 991 aa  191  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.21 
 
 		 1021 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 439 aa  191  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 1676 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 		 1808 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 3706 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 681 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  51.43 
 
 		 960 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 873 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 682 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1210 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 		 347 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  42.61 
 
 		 754 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 1390 aa  182  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 1177 aa  180  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 892 aa  180  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  41.87 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 980 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 1246 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  40.52 
 
 		 1182 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 886 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 788 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 913 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 909 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.97 
 
 		 1663 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 727 aa  173  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.25 
 
 		 1668 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 945 aa  171  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 492 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 764 aa  170  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  42.79 
 
 		 1289 aa  170  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 1253 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 872 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.45 
 
 		 1081 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  39.74 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.92 
 
 		 734 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  41.74 
 
 		 1248 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 613 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 382 aa  167  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 585 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 839 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4210  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 819 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 215 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 790 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 1047 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  38.74 
 
 		 800 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 551 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 912 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  39.32 
 
 		 676 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.97 
 
 		 1070 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 1391 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 890 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 782 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 		 1548 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 746 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  39.5 
 
 		 657 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 937 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 462 aa  157  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 1255 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1977 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 		 932 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 704 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 739 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 		 1070 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  35.1 
 
 		 902 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 752 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 856 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 1072 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 457 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>