More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1023 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  83.33 
 
 		 120 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  83.33 
 
 		 120 aa  202  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  81.67 
 
 		 120 aa  194  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  77.5 
 
 		 120 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  76.38 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  79.17 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  74.17 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 162 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 163 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  53.7 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  51.35 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 114 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  53.39 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  53.39 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>